在乌鲁木齐注册公司后，如果营业执照不幸丢失，可按以下步骤处理：
要登报声明作废。这一步需在乌鲁木齐本地公开发行的报纸上刊登，乌鲁木齐晚报》等。登报内容要包含公司名称、注册号、营业执照遗失声明等关键信息。费用大概在几百元，具体因报纸不同而有差异。登报后，保存好登报凭证，这是后续补办的重要材料。
准备补办所需材料。通常需要法定代表人签署的《营业执照遗失补领申请书》（可在乌鲁木齐市市场监督管理局官网下载打印并填写）、全体股东签署的公司章程、法定代表人身份证复印件、经办人身份证原件及复印件等。不同辖区可能会有些细微差别，比如天山区可能还会要求提供股东身份证明的额外补充材料等。
前往乌鲁木齐市市场监督管理局办理补办手续。要注意前往对应的辖区办事窗口，比如新市区的企业就去新市区市场监督管理局窗口。提交材料后，窗口工作人员会进行审核。审核通过后，一般在几个工作日内（通常3 - 5个工作日，加急办理的话，新疆疆企财税可在1 - 2个工作日完成）就能领取新的营业执照。
办理费用方面，乌鲁木齐官方办理营业执照补领是不收费的。但如果找新疆疆企财税代办，会收取一定的服务费用，具体费用根据服务内容和复杂程度而定。
乌鲁木齐注册公司所需材料一般包括：公司法定代表人签署的《公司设立登记申请书》；全体股东签署的公司章程；法人股东资格证明或者自然人股东身份证及其复印件；董事、监事和经理的任职文件及身份证复印件；指定代表或委托代理人证明；代理人身份证及其复印件；住所使用证明等。不同类型的公司可能会有一些特殊要求，比如注册一人有限公司，还需要提供一人有限责任公司章程。
乌鲁木齐注册公司流程大致如下：先进行公司名称预先核准，通过后确定公司类型、经营范围、注册资本等事项，接着提交设立登记申请材料，审核通过后领取营业执照，之后刻制印章、开立银行账户、办理税务登记等。
乌鲁木齐注册公司多少钱？官方登记注册费用主要是营业执照的工本费等，基本可忽略不计。但如果找新疆疆企财税代办注册公司，除了上述提到的代办营业执照补领费用外，代办注册公司还会收取一定费用，具体要根据公司注册的复杂程度、是否需要提供注册地址等因素综合确定。如果没有合适的注册地址，使用新疆疆企财税提供的政府备案正规注册公司地址，每年费用是1500元。
新疆疆企管理有限公司，专注乌鲁木齐本地企业服务10年。拥有实际办公地址，联系电话：13201316863，提供乌鲁木齐公司注册、代理记账、变更注销、资质办理、正规孵化器注册公司地址等一站式企业服务，专业会计团队一对一服务，全程代办无需本人到场。